Max Home IndustryИнициатива Чана Цукерберга объявила о финансировании более сорока инструментов с открытым исходным кодом, которые необходимы для биомедицинских исследований. У проектов OSS будет еще две возможности запросить финансирование, а второй раунд откроется в следующем месяце.
Основанная командой мужа и жены Марка Цукерберга, основателя и генерального директора Facebook, и педиатра доктора Присциллы Чан в 2015 году, Инициатива Чана Цукерберга (CZI) нацелена на использование технологий для решения некоторых из самых сложных проблем в мире — от искоренения болезней до улучшения образования и реформирования системы уголовного правосудия. В самом начале пара пообещала пожертвовать 99 процентов своих акций Facebook, затем оценила их в 45 миллиардов долларов и назначила три основные области: Образование, правосудие и возможности и наука.
Недавно объявленные гранты на общую сумму 5 миллионов долларов являются частью Основной программы программного обеспечения с открытым исходным кодом и были предоставлены 32 бенефициарам, охватывающим в общей сложности 42 проекта с открытым исходным кодом. Суммы в размере от 50 000 до 250 000 долларов пойдут на обслуживание программного обеспечения, рост, развитие и вовлечение сообщества.
Объявление о финансировании цитирует главу отдела науки CZI Кори Баргманна:
«Программное обеспечение с открытым исходным кодом ускоряет работу, которую ученые выполняют каждый день, будь то поиск последовательности генома для гена болезни, отслеживание вспышки болезни или подсчет клеток в изображении микроскопа.
Ученые хороши только настолько, насколько хороши их инструменты, и мы рады поддержать проекты с открытым исходным кодом, которые принесут пользу всему научному сообществу и помогут каждому ученому стать лучшим ученым.»
Выбранные проекты включают инструменты для визуализации, анализа и управления данными в таких областях исследований, как геномика, структурная биология, клеточная биология, нейробиология и многое другое. Они включают в себя хорошо известные, общеприменимые инструменты — такие как Matplotlib, Pandas, NumPy, SciPy scikit-learn и специализированные — такие как проект GATK с методами обнаружения и оценки вариантов у бактерий, OpenmMs, занимающийся масс-спектрометрией, и QIME2, который занимается исследованием микробиома. Руководители проекта поступают из различных университетов и авторитетных медицинских исследовательских организаций, включая Исследования рака Даны-Фарбера и Нью-Йоркский центр генома.
CZI приглашает больше заявок на финансирование в двух дополнительных циклах: второй раунд откроется 17 декабря 2019 года, а третий раунд-в июне 2020 года. Он ищет проекты программного обеспечения, которые необходимы для биомедицинских исследований, продемонстрировали эффективность и могут продемонстрировать потенциал для дальнейшего совершенствования. CZI рассмотрит две широкие категории проектов:
Специализированное программное обеспечение для анализа, визуализации и иной работы с конкретными типами данных, которые возникают в биомедицинской науке (например, геномные последовательности, микроскопические изображения и молекулярные структуры)
Основополагающие инструменты и инфраструктура, которые обеспечивают широкий спектр нисходящего программного обеспечения в нескольких областях науки и вычислительных исследований (например, численные вычисления, структуры данных, рабочие процессы и воспроизводимость). Основополагающие инструменты должны были продемонстрировать влияние на некоторые области биомедицинских исследований
Заявки могут запросить финансирование в размере от 50 000 до 250 000 долларов США.